すっごい難しい問題です。2010年のダイナなら12V制御かな？

症状を書き出すと…

• 転倒してリアの左ウインカーが壊れたのでリアウインカ―を左右とも変えた
• そしたらリアの後ろだけなんかついたりつかなくなったりするように
• 右後ろは正常。前の左右も正常
• で、リア側のコネクターで左右を入れ替えると今度は右がおかしくなる

こんな感じでしょうか？
やらしいな―

まず、フロント側が正常に動作するとかならスイッチ回りの疑いは晴れでいいと思います。

ウインカー本体は電源変えれば点灯するってことなのでコレも除外。アース不良の疑いは常につきまといますが、これも配線入れ狩れば点灯するということなので、まずは除外でいいかもしれません。

となると、今見るべきところってあんまりなくなってきて…

• メインハーネスからRフェンダーコネクター
• Rフェンダーコネクターからウインカーへのコネクター
• メインハーネスからウインカーモジュールコネクター
• モジュール本体

こんなところかと。

配線そのものは転倒時にいたんでいないと思うし、ノーマル状態なのであればまぁ大丈夫かなと思うので除外

ってことで、各コネクターの端子部分がおかしくなっていないかの総チェックといった感じになると思います。

で、ダイナなのでアース関係です。
エンジンがラバーマウントされている車種はエンジンとフレームをつなぐアース線があったかと思います。

こいつの接点とかが汚れている、もしくは線がボロいとかだとなんかよくわからん系の電装トラブルが発生することがあります。

一度チェックしてみましょう。ほかにもその頃の純正ハーネスってアース不良ネタが多いんだよな―。
もしかしたらウインカー回りもハーネス経由じゃなくて直接アース落としたほうがいいかもしれません。