了解しました。

色々聞かせてもらいましたが、正直イヤな予感しかしない状態です。

まず、音の種類的に回転部で間違い無いと思います。この回転部ってのは主に腰下かプライマリー、ミッションになるのですが、ミッションのであればミッションから音がするので今回は無し。

プライマイリーはエンジンから鳴っているのか区別が付きづらいのですが、59パンってことでおそらくTINカバータイプのハズです。

このタイプの場合ですと、もしトラブルがあったとすると結構派手めな音（チェーンの駆動音とかですね）が出るために今回のケースにはまらないためプライマリーの線も消しでいいかと。

あと結構治すのが楽なケースとして空気の出入り系ですが、ヘッドガスケットの抜けなんかも考えたんですけど、あれって放っておくと走行できないほどあっという間に育つ
（？）のでそれも却下です。

と、なると残りは腰下です。

最初は音の種類的にギヤのバックラッシュや、ジェネレーターマウントの不良てかネジの緩みなんかも疑ったのですが、かなり暖まらないと出ないこと、またひと夏超えてからの現象とのことで、この両方もいったん却下です。

残る可能性としてはビッグエンドベアリングが逝った可能性です。

この夏は暑かったので、もし猛暑の日に乗っていたようであればオーバーヒートによるエンジンへのダメージの可能性が非常に高いと判断します。

試しにタペットスクリーン、若しくはオイルをチェックしてみましょう。銀色を主体としたスラッジが多いようであればビッグエンド損傷で確定です。

今の情報量だと断定はできませんが、総合するとエンジン内に何らかのダメージが発生した可能性が非常に高いとおもってください。

ともかくすいません、応急処置もおそらくないです…

バイク屋さんに持っていってみましょう